L'archivio preunitario conservato presso il comune è costituto dai seguenti fondi: lega di Monterappoli, lega di Pontorme, comunità di Empoli, Mairie di Empoli, comunità restaurata di Empoli, Podesteria di Empoli, vicariato di Empoli, giudicatura di pace di Empoli, pretura di Empoli, pretura di Cerreto, podesteria di Montelupo, comunità di Montelupo, Lastra a Signa e Cerreto Guidi, prodotti e controllati dal cancelliere di Empoli. Presso l'archivio comunale si conservano inoltre gli atti prodotti dal comune postunitario e gli archivi aggregati dell'ECA, del patronato scolastico, dell'azienda agricola Vannucci Zauli, delle famiglie Salvagnoli Marchetti e Vannini-fattoria di Fornello, Vannini-avvocati di famiglia, della società anonima per la costruzione di un ponte, dell'amministrazione delle carceri, qui pervenuti a vario titolo.
E'infine relativa alla metà dell'anno 2006 l'acquisizione in deposito, da parte del Comune, dell'archivio storico dell'ospedale S. Giuseppe, di proprietà della ASL empolese...
